25-й сентай был сформирован на базе подразделений 10-го докурицучутая в Ханькоу, Китай, 7 ноября 1942 года. Первоначально истребителями Ки-43-I оснастили два чутая, а осенью 1943 года "Хаябусы" были во всех трех чутаях. Первым командиром 25-го сентая стал майор Тосё Сакагава. Часть входила в состав 1-го хикошидана. В апреле и мае в районе Рейрё 25-й сентай вел бои с частями 14-й воздушной армии генерала Клера Ли Шенно. 1 апреля 25-й сентай совместно с 33-м сентаем вел бой с двадцатью Р-40 и заявил четыре воздушные победы. 10 июня "Хаябусы" 25-го сентая вместе с 33-м сентаем сопровождали отряд легких бомбардировщиков Ки-48, бомбивших Сёйё. Пилоты сентая вступили в бой с десятком Р-40 и заявили пять сбитых истребителей.

С конца мая до середины июня 1943года 25-й сентай переходил с Ки-43-1-Хей на Ки-43-II-Ko. Летом американская 14-я воздушная армия в Кейрине, Сёйё и Рейрё начала наращивать штатную численность. 3-й хикошидан с помощью трех истребительных сентаев проводил "летнюю воздушную операцию", которая имела целью уничтожить американскую авиацию в Китае. Первый этап операции длился с 23 июля по 22 августа 1943 года. 21 августа Ханькоу стал целью для семи В-25 и 14 В-24, которых сопровождали Р-40. Двенадцать Р-40 выделили для сопровождения лишь в последний момент, поскольку истребители требовались для защиты Хеняна. Поэтому сопровождение оказалось лишь у В- 25. Четырнадцать В-24 из 374-го и 375-го дивизиона не смогли встретиться с истребителями, поэтому полетели бомбить доки Ханькоу без прикрытия. Во время бомбовой атаки "Либерейторы" попали под удар "Хаябус". Японские пилоты грамотно атаковали американские бомбардировщики из передней полусферы. Командир 25-го сентая, майор Тосё Сакагава сбил ведущий В-24, который пилотировал майор Брюс Бит. Другие В-24, были также атакованы противником. Тем не менее, американцы сбросили бомбы и ушли назад. Один В-24. имевший на борту трех убитых и двух тяжело раненных членов экипа- жа, разбился, совершая аварийную посадку.

Когда бомбардировщики ложились на обратный курс, в бой вступили "Хаябусы" из 33-го сентая, ко- торые непрерывно атаковали "Либерейторы" на протяжении получаса. Когда последний "Хаябуса" вышел из боя, десять из двенадцати В-24 оказались повреждены. Среди экипажей бомбардировщиков один человек погиб, четверо получили ранения. Бортстрелки "Либерейторов" заявили 57 сбитых истребителей, 13 сбитых вероятно и 2 поврежденных. В действительности им удалось сбить всего несколько "Хаябус". Китайская разведка после доложила, что в ходе налета было уничтожено множество строений и 1000 бочек бензина. В числе прочих домов, бомба угодила в здание японского штаба, где как раз шло оперативное совещание. Погибли три японских генерала, четыре полковника и командир морской базы.

Вторая операция продолжалась с 23 августа по 9 сентября. 24 августа самолеты 14-й воздушной армии снова появились над Ханькоу. В этом налете участвовало 14 В-24 и шесть В-25. Сопровождали бомбардировщики 14 Р-40 и 8 Р-38. "Митчеллы" успешно бомбили аэродром Учанг, расположенный на другом берегу реки, напротив Ханькоу, и вернулись на базу без потерь. По дороге к цели семь В-24 из 373-го дивизиона наткнулись на район плохой погоды и повернули на базу. Поэтому к Ханькоу прибыло только семь В-24 из 425-го дивизиона, которые успешно сбросили бомбы. Несмотря на сопровождение, японские истребители из 25-го и 33-го сентаев прорвались к бомбардировщикам, сбили четыре и повредили три машины. Японские пилоты также заявили два сбитых Р-40. В действительности ни одного Р-40 им сбить не удалось. В ожесточенном сражении, длившемся 45 минут, американцы сбили три "Хаябусы". В числе погибших оказался командир 33-го сентая, майор Акира Ватанабе. Три уцелевших "Либерейтора" вернулись на базу в Квейлине, имея на борту двух убитых и шестерых раненных.

В начале сентября 25-й сентай перебазировался в Ханькоу и Ханой. Это совпало по времени с началом третьей операции, которая продолжалась с 9 сентября по 7 октября 1943 года. 25-й сентай атаковал Конмей.

1-й чутай, который дислоцировался в Ханькоу, 15 сентября вел бой над Учангом с Р-40. В бою был сбит и попал в плен подполковник Гарри Пайк, заместитель командира 23-й истребительной группы. С июля по октябрь 3-й хикошидан записал 113 сбитых самолетов противника. 25-й сентай доложил о сбитых восьми В-24, 36 Р-40 и 7 Р-38, потеряв со своей стороны восемь "Хаябус". После этой кампании весь личный состав 25-го сентая вернулся в Ханькоу. Исключение составили несколько пилотов, которых направили в Кантон. 28 января 1944 года 25-й сентай праздновал свою сотую победу в воздухе.

В конце июня 1943 года из Ра-баула отвели 11-й сентай. В середине июля сентай вернулся в Японию, Там на аэродроме Тайсё в пригороде Осаки часть оснастили Ки-43-II-Ko, а в конце августа 11-й сентай отправили в Харбон в Манчжурии. 7 сентября часть прибыла на аэродром Лаолянь в восточной Манчжурии. В Лаоляне часть получила пополнение в летном составе и прошла реорганизацию. Потом ее отправили в Китай: сначала в Учанг в центральном Китае, а через неделю - в Кантон на юге Китая. В Кантон 11-й сентай прибыл 19 декабря. 21 декабря японская армейская авиация начала серию налетов, продлившихся три дня. В первый день операции еще до рассвета десять легких бомбардировщиков Ки- 48 атаковали Квейлин. На рассвете 41 истребитель Ки-43-II из 11-го и 25-го сентаев, а также Ки-44-II "Секи" из 85-го сентая вылетели для того, чтобы расчистить небо в районе цели. Однако союзники, по- видимому, узнали о планах японцев, поэтому нигде не было ни одного самолета - ни в воздухе, ни на земле. Во время обратного полета в Кантон Ки-43-II-Ko из 2-го чутая 11-го сентая, пилотированный 2-м лейтенантом Киёси Кино, упал в двадцати километрах северо-восточнее Сеуэй. У самолета кончилось топливо. Пилот попал в плен. 11 сентай действовал на юге Китая до февраля 1944 года. Потом часть отправили в Японию, где сентай получил новые Ки-84-1 "Хаяте". В дальнейшем часть действовала на Филиппинах.

Весной 1944 года, когда японцы начали "Операцию № 1". 25-й сентай действовал в составе 5-го хикошидана. Часть располагала 22 "Хаябусами" и 44 пилотами. Однако эта операция принесла японским ВВС больше потерь, чем побед. 10 марта 1944 года свой боевой счет в 25-м сентае открыл лейтенант Морицугу Канаи, который в районе Ачина сбил Р-38 из 449-го истребительного дивизиона. 6 мая, во время боя с "Лайтнингами" из того же дивизиона, "Хаябуса" Канаи получил повреждения. Из- за пробоин в бензобаке лейтенант едва дотянул до аэродрома. Приземлившись, Канаи пересел на другой Ки-43, снова бросился в бой и заявил два сбитых Р-38. В конце 1944 года Канаи имел на своем счету 19 сбитых самолетов, в том числе один В-29. До конца войны Канаи довел свои результаты до 32 побед. (По другим данным он сбил только 26 самолетов). В июле майора Сакагаву отозвали, а командиром 25-го сентая стал майор Беппу, который погиб в бою 17 сентября 1944 года. Следующим командиром сентая стал майор Мацуяма, который также погиб через две недели после вступления в новую должность. 4 августа 1944 года командование сентаем принял капитан Хасимото, но и он вскоре погиб. 3 сентября командиром 25-го сентая стал Такаси Цучия, только для того, чтобы погибнуть через несколько дней. 10 сентября 1944 года в 25-м сентае осталось лишь 16 "Хаябус" и 12 пилотов. В июне 1944 года бомбардировщики В-29 с базы в Сейто (Цинтао) начали бомбить Японию. Истре- бительным сентаям поступил приказ перехватывать В-29. 26 сентября пилоты 25-го сентая повредили один В-29 с помощью бомбы Та-Дан, и заявили еще четыре сбитых бомбардировщика. В октябре 25-й сентай получил пополнение и стал насчитывать 20 "Хаябус". В ноябре 2-й чутай оснастили истребителями Ки-84 "Хаяте", а другие чутай получили истребители Ки-43-III-Ko. 18 декабря 10 В-29 бомбили район Ханькоу. 25-й и 85-й сентай вели бой с бомбардировщиками В-24. В-25 и истребителями сопровождения Р-51. После этого боя в 25-м сентае осталось только два истребителя. В январе 1945 года 25-й сентай перебазировался в Нанкин, Китай, где часть целиком перешла на Ки-84 Тип 4 "Хаяте". В мае 25-й сен-тан перелетел в Пекин. В июне 5-й хикошидан перебазировался в Корею. Последним командиром 25-го сентая был майор Томохико Каназава (с июля и до конца войны).