Первый полет на нем совершил Джерардо Бараголия (Renate Gherardo Baragiola) летом 1911 года. После успешного испытания, самолет так же как и Ca.8 передали летному училищу при мастерских.

20 (30) января 1912 года Энрико Кобиони (Enrico Cobioni) на Ca.9 побил мировой рекорд скорости для самолетов с двигателем мощностью менее 40 л.с.

Ca.9 стал единственным сохранившимся из 71 построенных монопланов Капрони. В 1986 году к столетию авиаконструктора он был передан в Национальный Музей авиации и космонавтики в Вашингтоне, где прошел ряд реставраций. Через два года Ca.9 был возвращен в Италию в только что созданный Музей Капрони в Трентино, где и находится на сегодняшний день.